r语言热图-组学分组数据+归一化

author author     2023-05-11     330

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参考技术A R语言 热图-组学分组数据+归一化

Windows 10
R-4.0.4
R Studio: Version 1.2.1335

输入下列指令,从CSV文件导入数据,出去表头,为(6+6+6)*85矩阵数据,赋给test1变量
test1 <-read.csv("C:/Users/Administrator/Desktop/YsJ/sz/zzwkP1.csv",header=TRUE)
输入 test1 显示下列

输入如下指令,归一化矩阵数据,并赋值回来
test1 <- scale(test1)
结果如下图

输入如下指令
pheatmap(test1)

r聚类热图-数据的标准化

..._38706928/article/details/80329563关于R环境搭建可参考教程,【R语言入门】R语言环境搭建-绘制热图通过一些数学函数,将原始值进行映射。该方法包括log、指数、正切等。当变量是正偏态分布的时候,选用log对数。是否取对数可根据... 查看详情

熊猫数据帧的分位数归一化

】熊猫数据帧的分位数归一化【英文标题】:quantilenormalizationonpandasdataframe【发布时间】:2016-10-2212:00:00【问题描述】:简单来说,如何在Python中对大型Pandas数据帧(可能有2,000,000行)应用分位数归一化?PS。我知道有一个名为rp... 查看详情

归一化具有多个条件的数据帧,R

】归一化具有多个条件的数据帧,R【英文标题】:Normalizingadataframehavingseveralconditions,R【发布时间】:2019-09-2607:00:09【问题描述】:我有一个数据框(df),其中包含NA和数字。我想在以下条件下对其进行规范化:如果列仅包含NA,... 查看详情

R中连续神经网络训练中数据的归一化

】R中连续神经网络训练中数据的归一化【英文标题】:NormalizationofdataincontinuousneuralnetworktraininginR【发布时间】:2018-06-2921:32:10【问题描述】:随着我的输入不断涌现,我想对我的神经网络进行持续训练。但是,当我获得新数据... 查看详情

在 R 中使用均值 0 和标准差 0.5 对数据进行归一化

】在R中使用均值0和标准差0.5对数据进行归一化【英文标题】:Normalizingdatawithameanof0andastandarddeviationof0.5inR【发布时间】:2014-11-2310:15:54【问题描述】:我有一个数据集,我试图用0的平均值和0.5的标准差进行归一化。Standardizedatac... 查看详情

对两个数组进行分组和归一化

】对两个数组进行分组和归一化【英文标题】:groupbyandnormalizeovertwoarrays【发布时间】:2016-10-0716:17:51【问题描述】:我有一个DataFrame,其中的列是MultiIndex。第一个level指定\'labels\',第二个指定\'values\'。df.labels的(i,j)位置中的\'l... 查看详情

R中的归一化函数

...:21【问题描述】:我有一个要转换的矩阵,这样转换后的数据集中的每个特征都具有0的均值和1的方差。我尝试使用以下代码:scale<-function(train,test)trainmean<-mean(train)trainstd<-sd(train)xout<-testfor(iin1: 查看详情

SVM 分类 - R 中的归一化

...分类。在我使用SVM模型之前,如何标准化(或缩放)我的数据集中每列的特征?train<-read.csv("train.csv")test<-read.csv("test.csv")svm.fit=svm(as.factor(type)~., 查看详情

r语言plotly可视化:plotly可视化多个数据集归一化直方图(historgram)并在直方图中添加密度曲线kde(核密度估计的密度曲线densityplot)

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【r画图】环形热图

参考技术A热图(heatmap)在生信领域基本就是常规操作,基本技能,入门操作。能画热图的工具也有很多,我自己常用的R包是pheatmap。最近经常看见环状的热图,所以就搜了一下资料学习一下,测试一下。环状热图我也经常会在... 查看详情

为啥 R 文档指出可能出现大于最大归一化浮点数的数字?

】为啥R文档指出可能出现大于最大归一化浮点数的数字?【英文标题】:WhydoestheRdocumentationstatethatnumberslargerthanthelargestnormalizedfloating-pointnumbercanoccur?为什么R文档指出可能出现大于最大归一化浮点数的数字?【发布时间】:2021-06... 查看详情

运用r语言pheatmap包绘制热图进阶部分

...颜色,好像不是特别好看,根据自己美感慢慢调节运用R语言pheatmap包绘制热图进阶部分的内容就到这结束了。 查看详情

r语言plotly可视化:plotly可视化多个数据集归一化直方图(historgram)设置不同的直方图使用不同的分箱大小(binsize)在直方图的底部边缘添加边缘轴须图rug

R语言plotly可视化:plotly可视化多个数据集归一化直方图(historgram)、设置不同的直方图使用不同的分箱大小(binsize)、在直方图的底部边缘使用geom_rug函数添加边缘轴须图Marginalrugplots目录 查看详情

r语言使用vcd包的spine函数可视化spinogram图(spinogram图是被归一化的堆叠条形图这样每个条形的高度一样内部显示不同分布的比例)

R语言使用vcd包的spine函数可视化spinogram图(spinogram图是被归一化的堆叠条形图、这样每个条形的高度一样、内部显示不同分布的比例)目录 查看详情

如何在 LSTM 中有效地使用批量归一化?

...正在尝试使用R中的keras在LSTM中使用批量标准化。在我的数据集中,目标/输出变量是Sales列,数据集中的每一行记录一年中每一天的Sales(2008-2017)。数据集如下所示:我的目标是建立一个基于此类数据集的LSTM模型 查看详情

归一化小程序

一、---功能---将一列数据按照归一化公式来进行归一化,什么是归一化,这是数据处理中的一种数据的预处理手段,比如最大值是1000、最小值是0,将300进行归一化之后的结果就是0.3,就是将数据限制在0--1之内。二、---... 查看详情

数据归一化和两种常用的归一化方法

数据标准化(归一化)处理是数据挖掘的一项基础工作,不同评价指标往往具有不同的量纲和量纲单位,这样的情况会影响到数据分析的结果,为了消除指标之间的量纲影响,需要进行数据标准化处理,以解决数据指标之间的可... 查看详情

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