关键词：
说个简单的方法，如果你的md文件使用chrome预览，就比较简单了。点打印，目标，选本地另存为pdf，即可。看图：
这样保存的PDF非常完美，基本上你在chrome里预览是什么格式，保存完就是什么格式。
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2014-04-18更新，可能按这中操作生成的PDF文档中粗体（中文部分）可能会有问题，个人理解是与字体有关，可以按这样操作：
先选择这个，
然后选择：
这个可能与你电脑装的PDF软件会有关系，可能会有不同。
这样导出的PDF粗体是正常的。 参考技术A 这里提供一个曲线救国的思路：
PDF可以轻松转为Word文档，网上软件很多，就不多说了。
将Word文档中所有Markdown不支持的元素删除，当然也可以试试不删除，然后另存为html。
最后百度搜索html转markdown，把html的源码复制到在线转换页面中，就可以了。
没有亲自试过，只是理论可行本回答被提问者采纳
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