重磅!颠覆教科书!科学家找到癌症发生源头,治愈肿瘤有了新思路

大数据v 大数据v     2023-01-05     594

关键词:


导读:治疗肿瘤新思路。

本文经授权转载自学术头条(ID:SciTouTiao)

撰文:朱哼哼

编审:王新凯,排版:李雪薇

在癌症生物学发展的这几十年里,人们已经对癌症的起源达成了共识,即在正常细胞在分裂过程中,基因突变不断积累,导致致癌基因激活、抑癌基因失活,最终形成了癌细胞和肿瘤的发生。

但事实上,在每一个正常人的体内,都有可能存在成千上万的 DNA 突变细胞,然而只有在极少数情况下,这些发生了 DNA 突变的细胞才会癌变,导致癌症的发生。

为什么?

传统的解释是,只有 DNA 突变的细胞数量达到一定临界值,才会导致癌症的发生。


而现在,纪念斯隆凯特林癌症研究中心(MSK)的研究人员最新研究,成功颠覆了这一传统认知。

▲癌细胞(来源:scitechdaily)


MSK 癌症生物和遗传学大佬 Richard M. White 教授带领的研究团队,在黑色素瘤斑马鱼模型中找到了控制黑色素瘤形成的“必需基因”——ATAD2 基因。

他们在斑马鱼黑色素瘤易感模型中证实,敲除 ATAD2 基因,即使存在诸多致癌突变和抑癌突变,细胞依旧无法癌变形成肿瘤,而添加 ATAD2 基因,细胞则重新获得了癌变的能力。

因此研究人员认为,基因突变虽然是癌症形成的关键驱动因素,但并非所有具有突变的细胞都会癌变。细胞环境,尤其是细胞中的某些特定基因,与基因突变协同作用才能使正常细胞癌变,这种环境或基因称为“致癌能力”。靶向细胞中控制细胞“致癌能力”相关基因,或为癌症治愈提供了潜在可能。

本研究的主要作者、MSK的Scott J. Callahan 博士更是激动的表示:

细胞癌变好比烧火, DNA 突变只是一根点燃的火柴,如果没有木材或木头是湿的,那么只能得到一瞬间的闪烁而无法燃烧起来。但如果有干燥的木头和火种,那么整个就会燃烧起来。而在这个例子中,ATAD2 就是柴火。因此,未来除了靶向 DNA 突变,靶向 ATAD2 或许可以更有效地治疗癌症。

相关研究以“Developmental chromatin programs determine oncogenic competence in melanoma”为题发表在最新一期的 Science 杂志上。

01 黑色素细胞痣为什么可以不癌变?

近年来,通过基因组杂交和测序等先进的技术,科学家们发现了一系列关键的细胞信号传导通路和相关基因。其中,BRAF 基因突变与黑色素瘤的形成密切相关。目前,约 50%-70% 的黑色素瘤患者中均存在 BRAF 基因突变。

2003 年,就在 BRAF 致癌突变发现后不久,Pollock 教授等人便在黑色素细胞痣中发现了同样的突变,并且突变率高达 82%。也就是说,黑色素细胞痣虽然存在 BRAF 致癌突变,却可以数十年保持不癌变状态。

▲黑色素瘤(来源:NFCR)

2010 年左右,White 教授在读博士后期间发现,斑马鱼黑色素瘤模型中,许多癌细胞的基因特征更偏向于胚胎细胞而不是成熟的黑色素细胞。

随后在对斑马鱼黑色素瘤模型基因改造的过程中,White 教授进一步发现,在黑色素细胞发育的不同阶段引入 BRAF 基因会导致不同的结果。具体来说,神经嵴阶段的黑色素细胞以及成黑色素细胞在引入 BRAF 基因突变后均会癌变产生黑色素瘤,而成熟的黑色素细胞在引入 BRAF 基因突变后却并不会癌变,反而形成了黑色素细胞痣。

为了进一步证实这一现象在人类中也存在,White 教授和 Studer 博士合作。Studer 博士是人类多能干细胞(hSPC)领域的大佬,他的研究包括利用人类血液细胞制造 hSPC,并通过 hSPC 为身体的任何不同组织,例如大脑、肝脏、肺部等创建人体肿瘤模型。

于是,White 教授和 Studer 博士利用 hSPC 制造了神经嵴阶段、成黑色素细胞阶段以及成熟阶段的黑色素细胞,并将 BRAF 基因分别导入到上述细胞中,然后将这些细胞植入小鼠体内。结果仍旧只有神经嵴阶段以及成黑色素细胞阶段的细胞能够形成肿瘤。

这些结果表明,仅基因突变并不足以让正常细胞癌变。

02 谁赋予了细胞癌变的能力?

事实上,White 教授并不是第一个对这一现象感兴趣的人。

2016 年的时候,波士顿儿童医院 Leonard Zon 教授就发现,机体内的某些细胞已经发生了致癌突变,但却没有癌变。并随后在斑马鱼黑色素瘤模型中证明,即使所有的斑马鱼都携带 BRAF 突变并丧失抑癌基因 p53,仍旧只有当 Crestin 基因激活的时候,才会形成肿瘤。相关研究也曾发表在 Science 杂志上。

同时 Zon 教授提出了一个新的癌症形成模型,在癌基因激活及抗癌基因沉默或丢失时正常组织已做好了准备癌变,但只有组织中的一个细胞回复到更原始的胚胎状态并开始分裂时才会形成癌症。他们相信这一模型不仅适用于黑色素瘤,还适用于大多数(并非全部)的癌症。


▲来源:Pixabay

而在本研究中,White 教授和 Studer 博士在对斑马鱼和 hSPC 衍生的神经嵴阶段、成黑色素细胞阶段和成熟黑色素细胞基因表达进行了系统分析,旨在找到三者不同之处。最终,他们发现,三者之间最大的区别在于一种特定的基因 ATAD2,它在神经嵴阶段和成黑色素细胞阶段具有活性,而在成熟的黑色素细胞中没有。

ATAD2 即所谓的染色质修饰因子,可以与基因附近的染色体区域结合,并通过表观遗传学修饰,激活胚胎发育相关基因。近年来,众多研究表明,ATAD2 是一种典型的癌症相关分子,在前列腺癌、乳腺癌、黑色素瘤等多种癌症的发生和发展中发挥着重要作用。

为了证明 ATAD2 在黑色素瘤形成过程中发挥了决定性作用,研究人员在黑色素瘤斑马鱼模型中去除,然后重新加入了 ATAD2 基因。结果发现,当 ATAD2 基因被去除后,细胞失去了癌变的能力,而重新将 ATAD2 添加到细胞中,则细胞可以重新获得这种能力。这意味着,ATAD2 基因是黑色素瘤能否顺利形成的关键。


▲ATAD2在细胞癌变过程中的作用(来源:Science)

最后,利用 MSK 和癌症基因组图谱提供的大量数据,研究人员发现 ATAD2 基因激活的癌症患者生存率显著降低,这意味着它的确在癌症基因组方面发挥着重要的作用。

总的来说,White 教授和 Studer 博士及其团队的最新研究表明,黑色素瘤的形成取决于 ATAD2 基因掌握的“致癌能力”,没有它,即使拥有众多的致癌突变,黑色素细胞仍旧无法癌变。

研究人员表示,他们的研究结果为癌症形成提供了一个重要的新视角,与传统观点形成鲜明对比。

几十年来一直存在的标准想法是,基本上需要两种类型的 DNA 突变才能患上癌症:激活的致癌基因和缺失的抑癌基因,一旦清除了这两个障碍,癌症就会形成。现在我们有了完全不同的东西——致癌能力——它为癌症发生增加了第三层内容。


而这一研究成果更重要的意义在于,未来,靶向 ATAD2 基因或许有望开启治愈肿瘤的新方法。该团队为研究黑色素瘤而开发的 hPSC 技术也可能被证明在个性化癌症治疗中具有广泛的应用。


参考资料:
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abc1048
https://www.eurekalert.org/news-releases/926714

延伸阅读👇

延伸阅读《基因组:生命之书23章》

干货直达👇

更多精彩👇

在公众号对话框输入以下关键词

查看更多优质内容!

读书 | 书单 | 干货 讲明白 | 神操作 | 手把手

大数据 | 云计算 | 数据库 | Python | 爬虫 | 可视化

AI | 人工智能 | 机器学习 | 深度学习 | NLP

5G | 中台 | 用户画像 数学 | 算法 数字孪生

据统计,99%的大咖都关注了这个公众号

👇

癌症放疗有望在1秒内完成?科学家拟高效杀癌

美国能源部SLAC国家加速器实验室的科学家们正在开发一种基于加速器的新技术,有望将癌症放射治疗的持续时间从几分钟缩短到不足1秒,从而减小带给患者的副作用;同时,放疗设备的体积也将缩小,使其更容易在世界范围内... 查看详情

《抗癌前线:癌症研究的前沿进展》:肿瘤基因组学博士的肿瘤科普,三星推荐

...。专业性没问题,通俗易懂方面,比另外一本类似的书《癌症·真相:医生也在读》要低一档。总体评价三星。以下是书中一些重要信息的摘抄:1:也就是说,如果中国的癌症医疗水平能赶上美国,那么我们每年都有可能拯... 查看详情

文献导读-machinelearningidentifiesstemnessfeaturesassociatedwithoncogenicdedifferentiation(示例代

...章及封面聚焦人类伟大成就:癌症基因组图谱TCGA!改写教科书式突破! “癌症大地图”(Pan-CancerAtlas)肿瘤界“巅峰之作”:美国推 查看详情

诊断:胃恶性肿瘤?

胃类癌症,是一种严重威胁人民身体健康的疾病。以40~60岁多见。其发病原因不明,可能与多种因素如生活习惯、遗传素质,精神因素等有关,中国的胃癌发病率以西北最高,东北及内蒙古次之,华东及沿海又次之,中南及西... 查看详情

癌症免疫细胞治疗知识:car-t与tcr-t的区别在哪里?--转载

肿瘤免疫治疗,实际上分为两大类。一种把肿瘤的特征“告诉”免疫细胞,让它们去定位,并造成杀伤;另一种是解除肿瘤对免疫的耐受/屏蔽作用,让免疫细胞重新认识肿瘤细胞,对肿瘤产生攻击(一般来说,肿瘤细胞会巧妙伪... 查看详情

癌症检测算法头名_附代码

最近,近一万名数据科学家在数据科学方面参与开发机器学习算法,可以更精确地通过CT扫描检测癌变病变数据科学家正在使用机器学习来解决肺癌的检测。从1月份开始,世界各地近1万名数据科学家在Kaggle上竞争开发最有效的... 查看详情

癌症和反衰老未来产业研究----老年认知

癌症和反衰老未来产业研究----老年认知作者:刘安奇文章来源:水木峰.等(百度知道)大脑结构摘 要:了解年老过程中大脑在细胞水平上发生的变化对于揭示老年人认知功能下降的原因具有重要的意义。2.白质是神经系统的... 查看详情

c-12多肿瘤标志物蛋白芯片检验项目分别代表哪些部位?

...见于胚胎时期;有的是存在于正常人体内但含量微弱,患癌症时才超过正常值。通过对肿瘤标志物检测,可以早期预警或辅助诊断、分析病程、指导治疗、监测复发或转移、判断预后等。  1、甲胎蛋白(AFP):在胎儿时期存... 查看详情

mcp|解读人:dym|quantitativemassspectrometrytointerrogateproteomicheterogeneityinmetastaticlung

...lProteomics发表时间:(2019年4月)IF:5.236单位:1美国国立癌症研究院肿瘤研究中心胸及胃肠道恶性肿瘤分会,美国2SpectragenInformatics有限责任公司,美国3纽约大学医学院 系统遗传学与生物化学与分子研究所,美国 物种:... 查看详情

北京同仁堂中医治疗肿瘤经验丰富

...医治疗肿瘤经验丰富,汇集众多中医权威专家,数年不知治愈多少肿瘤患者......肿瘤是严重危害人类身体健康的疾病,不仅给患者带来身心的痛苦,给家庭带来沉重的精神压力和经济浮荡,也给社会生产力造成极大的损失。随着... 查看详情

2020年癌症检测行业液体活检专题研究报告

核心观点液体活检及肿瘤早筛是一个未来潜在市场空间巨大的细分医药子行业,属于分子诊断板块;美国Grail是液体活检龙头企业,中国液体活检行业尚处起步阶段;液体活检属于NGS产业链中游,技术门槛较高... 查看详情

重磅:语音编程来了!github势要颠覆程序员开发

作者|王启隆    出品|CSDN(ID:CSDNnews)十五年前,GitHub的第一行代码诞生。从那时起,GitHub的开源先驱将全球开发者集体视为目标,提供开发者们所需的一切,这一使命在GitHub平台的每次迭代中都保... 查看详情

personalis发布nextplatform更新,新增用于推进肿瘤生物标志物的关键定性功能

加州门洛帕克--(美国商业资讯)--先进癌症基因组学领域的领导者Personalis,Inc.(Nasdaq:PSNL)今天发布PersonalisNeXTPlatform®的最新扩展,增加若干新功能,这些功能对于理解肿瘤与免疫系统之间的相互作用以及它们如何影响癌症患... 查看详情

“颠覆性”科学已经衰落了

...#xff1a;难道这就是“灌水”的魔法。机器翻译如下:“颠覆性”科学已经衰落了——没人知道原因在过去的半个世纪里,将一个领域推向新方向的论文比例急剧下降。在过去的几十年中,发表的科学和技术研究论文的... 查看详情

机器学习逻辑回归对肿瘤预测(代码片段)

目录1逻辑回归api介绍2案例:癌症分类预测-良/恶性乳腺癌肿瘤预测2.1背景介绍2.2案例分析2.3代码实现2.4小结1逻辑回归api介绍sklearn.linear_model.LogisticRegression(solver=‘liblinear’,penalty=‘l2’,C=1.0)solver可选参数:‘libl... 查看详情

ai-basedpathologypredictsoriginsforcancersofunknownprimary

...科、生物医学信息学系、哈佛和麻省理工学院广泛研究所癌症项目做的。明确原发灶不明癌的起源是非常具有挑战性的科学问题或者医学问题。癌症基因组图谱(TCGA)和临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据集。使用截断的... 查看详情

字节跳动踏足健康领域,心理妇产肿瘤三大专科领域连投

字节跳动找到了流量最好的几个专科张一鸣独特“生命科学”探索之路,不靠研发药物和医疗器械,而是靠流量。有多少人还记得,张一鸣卸任字节跳动CEO时,曾解释自己要去探索生命科学了。9月,字节跳动... 查看详情

液体活检,ctc,cfdna,ctdna的概念

...样和分析。像传统的活检一样,这种类型的技术主要用作癌症等疾病的诊断和监测工具,其主要优点是无创。因此,它也可以更频繁地完成,从而可以更好地跟踪一段时间内的肿瘤和突变。通过在几周内进行多次液体活检样本,... 查看详情